Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR2P36980 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms