Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms