Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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HOXD13P35453 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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HOXD13P35453 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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HOXD13P35453 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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HOXD13P35453 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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HOXD13P35453 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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HOXD13P35453 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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HOXD13P35453 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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HOXD13P35453 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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