Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms