Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms