Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms