Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCAP28676 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCAP28676 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCAP28676 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCAP28676 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCAP28676 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCAP28676 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCAP28676 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCAP28676 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCAP28676 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms