Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms