Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms