Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF4P23510 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms