Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL1P22362 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL1P22362 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL1P22362 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL1P22362 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL1P22362 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms