Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASTP20810 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASTP20810 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASTP20810 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASTP20810 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASTP20810 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASTP20810 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASTP20810 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASTP20810 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms