Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms