Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF4P18848 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF4P18848 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms