Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTRB1P17538 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTRB1P17538 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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