Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms