Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG2P13521 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG2P13521 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG2P13521 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms