Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms