Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms