Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms