Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH3P11055 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH3P11055 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH3P11055 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH3P11055 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH3P11055 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYH3P11055 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYH3P11055 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYH3P11055 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYH3P11055 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYH3P11055 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYH3P11055 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYH3P11055 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYH3P11055 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYH3P11055 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MYH3P11055 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYH3P11055 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms