Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD8BP10966 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD8BP10966 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD8BP10966 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD8BP10966 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD8BP10966 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms