Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms