Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms