Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms