Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTA3P0C7M3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms