Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC175P0C221 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC175P0C221 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms