Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD4O95243 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MBD4O95243 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD4O95243 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms