Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms