Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP2O94887 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP2O94887 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP2O94887 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP2O94887 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP2O94887 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms