Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM2O94769 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECM2O94769 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms