Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms