Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF10O60809 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF10O60809 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms