Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms