Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNC1O60486 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms