Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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