Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms