Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF13O43567 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF13O43567 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF13O43567 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms