Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTIFO43310 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTIFO43310 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTIFO43310 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms