Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIAH2O43255 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms