Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms