Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms