Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3AO14802 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms