Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms