Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms