Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms