Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SSPOA2VEC9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms