Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HNF4GQ14541 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms