Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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KRTAP9-3Q9BYQ3 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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