Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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